В 1888 году на самых благоприятных в природном отношении, но пустовавших землях, взятых в аренду у Кубанского казачьего войска, была организована великокняжеская "Кубанская Охота". В первой половине 20 века оформилась идея о превращении кубанской охоты в заповедник для сохранения и размножения оставшихся зубров. В 1909 году академия наук подняла вопрос об организации Государственного Кавказского заповедника, но решения добиться не удалось. Империалистическая война 1914 года, а за ней и гражданская, намного отодвинули претворение в жизнь организацию заповедника. Только в 1920 году после установления советской власти вопрос об организации заповедника вновь был поднят. В 1924 году 12 мая был учрежден Кавказский государственный заповедник. На Кавказе он является самым большим и входит в пятерку крупнейших в стране.
Территория Заповедника представляет собой типично горный ландшафт и характеризуется высотными отметками от 260 до 3360 метров. Основу составляет Главный Кавказский Хребет, протянувшийся с северо- запада на юго- восток. Район заповедника имеет сложное геологическое строение, для которого характерно радиальное распределение горных пород разного возраста и состава. Некоторые районы заповедника (Лаго-Накское нагорье, г Фишт, Оштен, Пшехо-Су, Ачешбок, Трю, Ахун и др.) представляют собой карстовые ландшавты с очень большим количеством пещер. Так на Лаго- Накском нагорье больших насчитывается свыше 130.
Не являются редкостью и ледники. Их на территории около 60, а общая их площадь - 18,2 км кв.
Около 2% территории заповедника приходится на реки и озера. Самые крупные из них - Мзымта, Хоста, Сочи, Шахе, Белая, Малая Лаба, Закан, Дамхурц, Киша, Курджипс. Реки представляют собой типичные горные потоки с часто встречающимися водопадами, узкими скальными ущельями, теснинами и каньонами. Насчитывается около 120 озер. Самое популярное - озеро Хуко (1843 над у.м.).
Горный рельеф вызывает высотную полостность климата, обуславливающую полное распределение ландшафтов и их неотъемлемых компонентов - почве и растительности. На каждые 100 метров поднятия в горы над уровнем моря температура падает на 0,5 градуса. Близость моря, Главный Кавказский Хребет обусловили формирование на территории заповедника различных климатов - от влажного субтропического до сурового высокогорного.
Флора Кавказского заповедника насчитывает около 3000 видов. Для флоры заповедника характерно наличие древних видов и представителей, имеющих органическое распространение. Каждое пятое растение является эндемиком или реликтом. Например, тисс ягодный, самшит, падуб, лавровишни. Есть и корень жизни - Женьшень, его первые семена были высеяны в 1954 году в районе кордона Киша, на склоне горы Пшекиш.
Фауна включает в себя 89 видов млекопитающих: горный зубр, кубанский тур, кавказская серна. Кавказский благородный олень, косуля, кабан. Волк, кавказский бурый медведь, рысь, лиса, шакал, кавказский барсук, кавказская выдра, лесной кот, лесная и каменная куница и др. Насчитывается 248 птиц, 15 пресмыкающихся, 9 земноводных, 21 рыба, более 100 видов моллюсков и около 10000 видов насекомых. Много из них эндемиков и реликтов. Самым главным представителем фауны заповедника считается зубробизон. Кавказский зубр восстановлен в послевоенные годы. Последний экземпляр был уничтожен в 1927 году бандой белогвардейского генерала Фостикова. Восстановить популяцию было уже не возможно, но ученые решили возвратить кавказским лесам горных быков путем скрещивания гибридов зубра и бизона с чистокровным зубром. К счастью еще в 1907 году егерь Кубанской охоты изловил близ устья Безыменки маленького зубренка. Зверь сначала попал в Беловежскую пущу а затем в Гамбургский зоопарк, и его потомство от беловежских зубриц составио группу зубров кавказской линии. В 1940 году были завезены в Аскания-Нова 5 зубробизонов в специально устроенный зубропарк. Во время войны гитлеровцы трижды бомбили его, стресясь истребить стадо, но зверей удалось спасти. Годы кропотливого труда, поиска эксперимента дали положительный результат: сейчас поголовье зубров восстановлено. Живой вес быка достигает тонны, а шкуры 100 кг. В Красную книгу занесены 8 видов животных, обитающих в заповеднике.